在ubuntu上装Generic Grid Generator (g3)或(gCubed)
g3是专门为pop海洋模式设计模式水平网格所用的图形软件。由POP的娘家LANL开发（小作坊式的），现在已经停止技术支持。但如果你用ccsm3，或者干脆就是pop，又想做古气候模拟，那很抱歉，你不得不和这个小工具打交道了。
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编译gCubed需要安装的库函数包：netCDF和VTK4.2
编译器为F90，C＋＋
GUI解释器还需要expectk
此外，为编译上述库函数或gCubed本身，还需要cmake, icc,ifort,g++,c++,gfortran
（如果是在裸机上装，境况将相当悲惨。。。）
所幸，在小U上，大部分软件都直接可以sudo apt-get install 软件名，一个命令就OK，当然，前提是你连在网上。
这些可以直接安装的软件包括： cmake ,VTK 5.0（注意不是4.2，版本不一样，所以才麻烦大了，万恶的gcubed...)，gcc/g++/c++/gfortran(感谢强大的gcc编译家族，虽然有些时候也会失灵，而暂时的输给intel家族)，expectk
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当然，netCDF也是可以直接sudo apt-get install，不过，默认安装路径似乎不能自己指定，这让我很不爽，于是自己下载3.6.2版源代码，自己编译，用起来自己知道在那里，方便了很多。具体方法也说一下吧：
先要装ifort（intel fortran）
用电子邮件注册，取得注册码，下载源码包，解压，照着说明书一步一步装，命令记得最好加sudo。
ifort装好后，在.bashrc中添加如下两行：
export PATH=$PATH:/opt/intel/idb/10.0.023/bin/
export PATH=$PATH:/opt/intel/fc/10.0.023/bin/
之后，一切正常
编译netcdf时可能会遇到gcc版本问题，在.bashrc中添加如下一行以设置gcc路径：
export GXX_ROOT=/usr/lib/gcc/i486-linux-gnu/4.0.3/
编译安装netcdf，需要使用下面命令：
（如果ifort命令可以使用的话）
export FC=ifort
export F90=ifort
export FFLAGS="-O -mp"
export CPPFLAGS="-DNDEBUG -DpgiFortran"
如果ifort不能使用，则将其替换为/opt/intel/fc/9.1.043/bin/ifortbin；
然后：
sudo ./configure --prefix=/usr/local
sudo make check
sudo make install
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然后是VTK4.2，不得不说，本来5.0就够用了，如果不是gcubed的话。可惜4.2版本里的有些过时的内容还要在gcubed里用到，没办法，只好千辛万苦从网上下一个源码包，解压到/home/wy/下，然后：
> cd /home/wy/VTK
> cmake -i
> make
make过程中，有几个地方报错，是由于c++编译器版本太高了，我把出错的函数都给注释了，不影响大局的，就OK了。
注意安装顺序，icc装好设置好之后，cmake会默认使用icc编译，但这里用icc过不去，所以只好把.bashrc中路径设置注释掉，重启系统，默认使用cc或gcc,g++编译，才顺利装好VTK4.2。
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之后（最好是在装好VTK4.2之后），装icc，和ifort类似，只不过路径设置只需在.bashrc中添加如下一行即可：
export PATH=$PATH:/opt/intel/cc/10.1.008/bin/
注意设置.bashrc之后都要重启终端，以刷新.bashrc
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最后才是gcubed包，版本为2007年8月16日更新的版本。解压到/home/wy，然后：
cd /home/wy/gCubed/tripole/build/ %这里不需修改，但要删除原来编译好的.o文件
rm *.o
make
第一个部分tripole编译没什么问题
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cd /home/wy/gCubed/hg2nc/build/
需要修改该目录下的makefile文件：
CC = g++
CCFLAGS = -g
VTK_INC = -I/home/wy/VTK \
-I/home/wy/VTK/Common \
-I/home/wy/VTK/Filtering \
-I/home/wy/VTK/Graphics \
-I/home/wy/VTK/Hybrid \
-I/home/wy/VTK/IO \
-I/home/wy/VTK/Imaging \
-I/home/wy/VTK/Rendering \
-I/home/wy/VTK/Utilities/jpeg \
-I/home/wy/VTK/Utilities/png \
-I/home/wy/VTK/Utilities/zlib \
-I/home/wy/VTK/Wrapping \
-I/home/wy/VTK/Wrapping/Tcl
netCDF_INC = -I/user/local/include \
-I/home/wy/netcdf-3.6.2/cxx
INC_DIRS = $(VTK_INC) $(netCDF_INC) -I../include
OBJS = goyou2pop.o etopo.o text2nc.o
VTK_LIBS = -L/home/wy/VTK/bin -lvtkRendering -lvtkGraphics \
-lvtkImaging -lvtkFiltering -lvtkCommon -lvtkIO -lvtkHybrid \
-lvtkftgl -lvtkfreetype
netCDF_LIBS = -L/usr/local/lib -lnetcdf_c++ -lnetcdf
上面是makefile文件需要修改的部分，VTK的库用的是4.2版本的，其lib在/home/wy/VTK/bin下，我的netCDF装在/user/local/下的lib和include下，源代码在/home/wy/netcdf-3.6.2/下。
改好之后，make就可以了。
这样，第二部分ok。
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cd /home/wy/gCubed/e3/build/
修改Makefile文件：
CC = c++
CCFLAGS =
VTK_INC = -I/usr/include/vtk-5.0
netCDF_INC = -I /usr/local/include
INC_DIRS = $(VTK_INC) $(netCDF_INC) -I../source
OBJS = coastlines.o gridLines.o pickCallBack.o subPickCallBack.o \
controls.o gridValues.o subGridLines.o textDisplay.o \
fastEd.o subGridValues.o topography.o
VTK_LIBS = -L/usr/lib -L/usr/lib/vtk-5.0/CMake \
-L/home/wy/VTK/bin -lvtkRendering -lvtkGraphics \
-lvtkImaging -lvtkFiltering -lvtkCommon -lvtkIO -lvtkHybrid \
-lvtkftgl -lvtkfreetype
netCDF_LIBS = -L/usr/local/lib -lnetcdf_c++ -lnetcdf
上面修改的部分中，VTK的include文件用的是5.0版本，lib也大部分是5.0版本，但只用5.0版本编译时会报错，说有个libvtkfreetype.so找不到，据查，这个库在5.0中已经消失不见，只好补上4.2版本的lib文件路径，于是make，顺利ok。
第三部分也好了
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cd /home/wy/gCubed/nc2pop/build/
修改makefile为如下内容:
FC = gfortran
FFLAGS =
INCS = -I/usr/local/include
OBJS = pop2grid.o
LIBS = -L/usr/local/lib -lnetcdf
../../run/pop2grid: pop2grid.o netcdf.o
gfortran -o ../../run/pop2grid -g -O0 pop2grid.o netcdf.o -L/usr/local/lib -lnetcdf
pop2grid.o: ../source/pop2grid.f90 netcdf.mod
$(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $<
netcdf.o:
cp /home/wy/netcdf-3.6.2/f90/netcdf.o .
netcdf.mod: typesizes.mod
cp /home/wy/netcdf-3.6.2/f90/netcdf.mod .
typesizes.mod:
cp /home/wy/netcdf-3.6.2/f90/typesizes.mod .
这个文件里用的编译器本来是pgf90，就是前面提到的f90，用gfortran替换。
然后make，一切顺利的话就搞定了，万事OK.
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